易引起骨质疏松症
咖啡因易与人的游离钙结合，并经尿。游离钙的减少必然引起结合钙的分解，从而导致骨质疏松。
长期每天饮杯以咖啡而不饮牛奶的老年妇女，不管年龄、肥胖程度如何，其髋骨、脊椎的骨密度都会降低，且降低的程度与习惯延续的时间长短和饮用量的多少有关。
易引起糖尿病
芬兰和美国的研究人员通过调查分析发现，这两个国家都是消费咖啡最多的国家，其结果是，这两个国家中患糖尿病的人数也最多。
其中，芬兰人的咖啡消费量居世界之首，该国的糖尿病患者也是世界最多的。其他北欧国家的咖啡消费量也大，患糖尿病的人数也多。
相反，日本人的咖啡消费量在世界是最少的，糖尿病患者也最少。研究者分析认为，咖啡饮料中含有的咖啡因可以透过胰脏而沉淀到胎儿组织中，尤其是胎儿的、大脑，使出生后的婴儿可能患糖尿病。
易患不孕症
据美国科学家研究发现，每天饮杯咖啡的妇女比不饮咖啡的妇女易患不孕症。有关专家曾调查了有饮用咖啡习惯的名妇女，其中约有名妇女不易受孕。
也有些生育专家认为，这是小范围的研究，不能最后证实咖啡对生育的特殊作用。但是，研究人员强调指出，如果不能从学说明不育症的原因，则应考虑不育症与咖啡因有关。
增加心梗危险
每日饮杯或更多的咖啡，可使妇女患心肌梗塞的危险增加%，而且危险随着饮咖啡的数量增加而增加。
