论文称，为评估奥米克隆株在中国的传播方式、可能出现症状的重症患者比例，以及疫情防控措施调整后，本次疫情在中西部大城市和农村的趋势，中国工程院院士、上海交通大学医学院附属瑞金医院转化医学国家重大基础设施陈赛娟团队与上海公共卫生临床中心范晓红团队联合攻关，在《医学前沿》发表研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》。
研究团队对2022年秋冬季上海市公共卫生中心随机选取的378名患者进行基因组测序，发现主要毒株包括近期在欧美出现的BF.7、BA.5.2、BQ.1和XBB，但未发现新的新冠肺炎突变株。
研究团队分析了2022年9月1日至2022年12月26日上海市公共卫生中心5706例有症状的新冠肺炎感染患者的临床演变情况，其中3.03%的患者发展为重症/危重症。
根据新冠肺炎的全基因组序列研究，95.95%的基因组序列集中在5个Ormykonya系。交通医学院供图
结果提示，随着疫情演变带来的病毒传播途径的改变，奥米克隆多种亚型在中国同时传播。在最近出现新冠肺炎感染症状的人群中，重症病例主要集中在患有基础疾病的老年人中。从元旦到春节，新冠肺炎疫情将主要影响农村地区和中小城市地区。特别值得关注的是，我国农村和中小城市的医疗资源相对匮乏，有大量的老年人和基础疾病人群。春运期间城乡人口的流动性将极大地影响疫情趋势。
重症病例主要集中在有基础疾病的老年群体。
本文对2022年秋冬季上海市公共卫生中心随机抽取的378例患者进行了基因组测序，获得了369条高质量的新冠肺炎基因组序列。
根据分析，这些病毒的基因组包含全球共享所有流感数据倡议的数据库中记录的30个Omicron亚型毒株，其中355个基因组序列集中在5个奥美毒株中。主要毒株有北京、广州已报道流行的BF.7、BA.5.2，以及欧美近期出现的BQ.1、XBB。
结合感染者的旅行史和感染接触史，证明有北京或广州疫情接触史者分别主要携带BF.7和BA.5.2亚株；从境外进入上海的感染者主要携带BQ.1和XBB；除了BA.5.2，上海还有很多株的克雷伯氏菌。在这些结果中没有发现新的新冠肺炎突变体。
由于抗击新冠肺炎感染的任务已经转向重症病例的预防和治疗，研究小组分析了本次疫情截至2022年11月29日的重症/危重病例数和感染总人数的变化，发现重症/危重病例数随着感染人数的增加而增加，比例达到0.035%。
按照一般规律，高危人群在入院2-3周后成为重症/危重症患者。研究小组分析了2022年9月1日至2022年12月26日在上海公共卫生中心接受治疗的5706名有症状的新冠肺炎感染患者的临床演变情况。
经过全面的医学观察和诊断，5533名患者表现为轻度和普通型，其余173名患者进展为重症/危重症，其中包括20名新冠肺炎感染患者和153名因新冠肺炎感染而加重的基础疾病患者。此外，老年人和男性患者患严重/危重疾病的风险显著增加。
利用数学模型，研究小组初步预测了奥米克隆疫情的趋势。
预计元旦至春节期间疫情主要影响农村和中小城市地区。
本文还利用数学模型对奥米克隆的流行趋势进行了初步预测。
本研究以北京、广州、上海、重庆等地的感染者常规核酸检测数据为基础，建立了数学模型
但基于重庆市区和郊区数据的数学模拟分析，提示郊区疫情高峰有所延迟，春运高峰期间由于疫情的加速传播，感染高峰将明显增强。
对四川、陕西、甘肃、青海等省份，除省会城市外的地区进行了疫情预测。预计农村和中小城市地区的感染高峰将出现在2023年1月中下旬，由于春运高峰，这些高峰也可能提前到来。
课题组分析结果认为，从元旦到春节期间，新冠肺炎疫情将主要影响农村地区和中小城市地区。特别值得关注的是，我国农村和中小城市的医疗资源相对匮乏，有大量的老年人和基础疾病人群。春运期间城乡人口的流动性将极大地影响疫情趋势。
因此，迫切需要启动奥米克隆疫情向农村扩散的应急预案，将更多的医疗资源配置到农村基层，做好有效药物和新型疫苗的应急使用许可工作，做好抗新冠肺炎特效药和辅助药、疗效确切的中药的生产、储存、配送和临床合理使用工作。同时，要实施分类分层救治，加强中小城镇危重救治能力，继续用好非药物公共卫生措施，努力降低疫情峰值，缓解医疗系统和医务人员的沉重压力。
此外，课题组认为有必要继续开展高危人群全程免疫，启动高危人群第四次加强免疫；加强个人和家庭防控知识技能的普及，做好健康宣传和风险沟通，保护人民群众特别是弱势群体的生命健康，确保我国平稳走出疫情，促进社会经济有序恢复和发展。
